Село на месте пустоши.

В какое именно время возрожденное Клишино стало селом, то есть когда в нем построили церковь, точно сказать нельзя, но согласно все той же книге о. Иоанна Добролюбова «Историко-статистическое описание церквей и монастырей Рязанской епархии», в «Окладных книгах» 1676 года уже упоминается церковь Рождества Пресвятой Богородицы в селе Клишино. Служил в том храме отец Леонтий, а на приходе храма числился один двор боярский и 16 дворов крестьянских. Церковь не имела своей земли и сенокоса, а причт содержался прихожанами, дававшими батюшке и причетникам 6 четвертей ржи «в московскую меру» да 5 рублей деньгами.

Это было весьма недурно для той поры! Мера сыпучих тел, называемая «четверть», в переводе на современную метрическую систему равнялась без малого 210 литрам. Другими словами, отец Леонтий получал 1260 килограммов зерна и деньгами 5 рублей – это был годовой денежный оклад московского стрельца. В ту пору корова стоила 2 рубля, курица 3 копейки, около килограмма печеного хлеба – три четверти копейки. В одном рубле было 33 алтына и 2 деньги. В алтыне было 6 денег. После отца Леонтия служил его сын, Дмитрий Леонтиев, рукоположенный в сан 10 декабря 1694 года. Кто был после него, свидетельств не сохранилось. Более подробно документы начинают сообщать о клишинском священстве, начиная с 40-х годов XVIII столетия. Это было время больших перемен в Клишино! Им тогда владели сразу несколько помещиков, имевших доли в окрестных угодьях. Самым знаменитым из здешних владельцев был граф Михаил Гаврилович Головкин, сын канцлера времен Петра Великого, который лишился своего имущества в результате политических пертурбаций 1741 года, когда в результате дворцового переворота к власти пришла императрица Елизавета Петровна, одним из главных политических оппонентов которой считался как раз граф. К моменту конфискации имущества в селе Клишино было 37 дворов, а в них жили 229 жителей обоего пола.